戦闘員、イソギンチャック、サラセニアン、キノコモルグ、
アリガバリ、カニレーザー、ノミ怪人、
マシーン大元帥（１話）、地獄大使（３話）
Ａ：戦闘員控え室、Ｂ：牢屋、Ｃ：空室、Ｄ：倉庫、Ｅ：会議室、Ｆ：ボス部屋
Ｆのボス部屋以外行く必要のある部屋はない。
１話と３話で来ることになるが、探索するのは１話のみ。
第１話では無駄部屋でも一応人がいる（ＣとＥは無人）。
３話ではイベントでボス部屋に直接乗り込む。
ショッカーの基地なので、出現する敵は怪人系のみ。
| 東京地下基地（第１話、第３話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、イソギンチャック、サラセニアン、キノコモルグ、 アリガバリ、カニレーザー、ノミ怪人、 マシーン大元帥（１話）、地獄大使（３話） |
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| ■各部屋 Ａ：戦闘員控え室、Ｂ：牢屋、Ｃ：空室、Ｄ：倉庫、Ｅ：会議室、Ｆ：ボス部屋 |
| ■備考 Ｆのボス部屋以外行く必要のある部屋はない。 １話と３話で来ることになるが、探索するのは１話のみ。 第１話では無駄部屋でも一応人がいる（ＣとＥは無人）。 ３話ではイベントでボス部屋に直接乗り込む。 ショッカーの基地なので、出現する敵は怪人系のみ。 |
| ヒマラヤ基地（第２話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、キノコモルグ、ノミ怪人、アリガバリ、イソギンチャック、カニレーザー、 サラセニアン、タイガーロイド、イカデビル |
ヒマラヤ基地１Ｆ |
ヒマラヤ基地２Ｆ |
| ■各部屋 Ａ：空室、Ｂ：バベル、Ｃ：パソコン室、Ｄ：空室、 Ｅ：バベル、Ｆ：バベル、Ｇ：バベル、Ｈ：バベル・ボス部屋 |
| ■備考 ２ＦのＢ、３ＦのＥＦＧの４部屋にバベルがあるので入って止めること。 ショッカーの基地なので、出現する敵は怪人系のみ。 |
| ダーウィンへの抜け道（第２話） |
| ■出現敵キャラ なし |
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| ■備考 １の場所にいるマルコ少年と会話でイベント。 |
| 鹿児島怪しいビル（第３話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、イソギンチャック、アリガバリ、サラセニアン、キノコモルグ、カメバズーカ、 カニレーザー、サタンスネーク、ノミ怪人、タイガーロイド、グランザイラス、 ウルトラキラー |
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| ■各部屋 Ａ：戦闘員控え室、Ｂ：牢屋、Ｃ：空室、Ｄ：倉庫、Ｅ：会議室、Ｆ：ボス部屋 |
| ■備考 Ｆのボス部屋以外の部屋は何も無い。 ショッカーの基地なので、出現する敵は怪人系のみ。 |
| 高知敵秘密基地（第３話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、サラセニアン、アリガバリ、カニレーザー、ノミ怪人 |
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| ■各部屋 Ａ：戦闘員控え室、Ｂ：牢屋、Ｃ：空室、Ｄ：倉庫、Ｅ：会議室、Ｆ：ボス部屋 |
| ■備考 Ｆのボス部屋以外の部屋は何も無い。 ボスはただの戦闘員。一般敵としてもでてくる。 ショッカーの基地なので、出現する敵は怪人系のみ。 |
| カリカリ収容所（第３話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、キノコモルグ、ノミ怪人、アリガバリ、カニレーザー、 サラセニアン、エジプタス、カメバズーカ、サタンスネーク、グランザイラス、地獄大使 |
| カリカリ収容所１Ｆ |
| カリカリ収容所２Ｆ |
| ■各部屋 Ａ：食堂、Ｂ：牢屋、Ｃ：パソコン室、Ｄ：地獄大使の書斎、 Ｅ：牢屋（ライダーキラー）、Ｆ：牢屋、Ｇ：牢屋（ヒーロー）、Ｈ：通信室 |
| ■備考 目的地はＥとＧの部屋のみ。Ｄの部屋は負けイベント。 ショッカーの基地なので、出現する敵は怪人系のみ。 |
| カッパドキアの入り口（第５話） |
| ■出現敵キャラ チブル星人、バルタン星人Ｊｒ．、ガッツ星人、エジプタス、サタンスネーク、 ガラガランダ、百目タイタン、サラセニアン、キノコモルグ、カニレーザ、 タイガーロイド、エレキング、バルタン星人 |
カッパドキアの入り口１Ｆ |
カッパドキアの入り口２Ｆ |
| ■各マーキング １：二宮博士、２：エレキング、３：バルタン星人 |
| ■備考 ２の場所には何も無いが、突如ボス戦になる。３の場所では突然バルタン星人が出てくる。 |
| パリ秘密基地（第５話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、キノコモルグ、ノミ怪人、アリガバリ、カニレーザー、 サラセニアン、エジプタス、カメバズーカ、タイガーロイド、 サタンスネーク、グランザイラス、百目タイタン、ガラガランダ、ライダーキラー チブル星人、ジェロニモン、バルタン星人、バルタン星人Ｊｒ．、ガッツ星人 |
パリ秘密基地１Ｆ |
パリ秘密基地２Ｆ |
パリ秘密基地３Ｆ |
| ■各部屋 Ａ：食堂、Ｂ：キッチン、Ｃ：倉庫、Ｄ：司令室、Ｅ：図書室、Ｆ：書斎 |
| ■備考 Ｄの司令室以外の部屋は何も無い。 １Ｆにマグマライザーが待機しているがボス撃破まで出ることは出来ない。 １Ｆ出入り口も封鎖されている。 ここでのランダムエンカウント１回毎に人類・地球カウンターが減る。 何故か怪獣系の敵が出現する。 |
| ダミーコロニーレーザー（第７話） |
| ■出現敵キャラ バルタン星人Ｊｒ．、ガッツ星人、 ハンブラビ（灰）、ガザＣ、ガザＣ改ガザＤ、ズサ、ズサ改、バウ（橙）、バウ（青）、 クインマンサ＆ファンネル、キュベレイII＆ファンネル、ジオ、サザビー＆ファンネル 百目タイタン、ガラガランダ、アポロガイスト、シャドームーン |
ダミーコロニーレーザー１Ｆ |
ダミーコロニーレーザー２Ｆ |
| ■各部屋 Ａ：格納庫、Ｂ：会議室、Ｃ：控え室、Ｄ：控え室、 Ｅ：控え室、Ｆ：牢屋、Ｇ：倉庫、Ｈ：司令室 |
| ■備考 Ｈの部屋以外の部屋は何も無い。 Ｈの部屋ではイベントのみでボス戦はない。 ここでのランダムエンカウント１回毎に人類・地球カウンターが減る。 ネオジオンの基地なのに怪獣系や怪人系の敵が出現する。設定的におかしい。 |
| ソロモン（第７話） |
| ■出現敵キャラ ベムスター、 ハンブラビ、ハンブラビ（灰）、ジオ、 ズサ、ズサ改、ガザＣ改、ガザＤ、バウ（橙）、バウ（青）、 キュベレイII＆ファンネル、クインマンサ＆ファンネル、サザビー＆ファンネル、 デナンゾン、バグ |
ソロモン３Ｆ |
ソロモン２Ｆ |
ソロモン１Ｆ |
| ■各部屋 Ａ：格納庫、Ｂ：空室、Ｃ：エレベーター、Ｄ：空室、Ｅ：司令室、 Ｆ：空室、Ｇ：エレベーター、Ｈ：空室、Ｉ：空室、Ｊ：空室、Ｋ：エレベーター、Ｌ：空室 |
| ■備考 Ｈの部屋以外の部屋は何も無い。 Ａの格納庫が出入り口。 格納庫でいきなりデナンゾンに襲われる。 Ｌの空室でバグに襲われる。 バグ撃退後、Ｅの司令室にネオジオン兵が現れる。 ２Ｆには何もないので行く必要はない。 |
| 乗っ取られたホワイトベース（第８話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、サラセニアン、イソギンチャック、アリガバリ、エジプタス、キノコモルグ、 イカデビル、ガラガランダ、カメバズーカ、カニレーザー、 アポロガイスト、百目タイタン、サタンスネーク、ノミ怪人、シャドームーン、 グランザイラス、タイガーロイド、暗闇大使、ライダーキラー |
ホワイトベース１Ｆ |
ホワイトベース２Ｆ |
| ■各部屋 Ａ：格納庫、Ｂ：格納庫、Ｃ：倉庫、Ｄ：エレベーター、Ｅ：船室、Ｆ：船室、Ｇ：船室、 Ｈ：オペレーション室、Ｉ：船室、Ｊ：会議室、Ｋ：エレベーター、Ｍ：ベッド部屋、Ｎ：台所 |
| ■備考 プロローグでも内部を移動する。 ８話でショッカーに乗っ取られているため、怪人ばかり出現する。 しかし怪人はいずれも序盤や中盤の敵ばかりなので弱い。 しれっとイカデビルがザコになっている。 ３Ｆは司令室直通。 ２Ｆには何もないので行く必要は無い無駄エリアとなっている。 ８話では司令室でのボス戦の後、倉庫でイベントが始まる。 |
| ７０９コロニー・ショッカー本部（第８話） |
| ■出現敵キャラ 戦闘員、サラセニアン、イソギンチャック、エジプタス、キノコモルグ、イカデビル、 ガラガランダ、カニレーザー、アポロガイスト、百目タイタン、サタンスネーク、 ノミ怪人、シャドームーン、グランザイラス、タイガーロイド、エージェント |
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| ■各部屋 Ａ：マシーン大元帥の部屋、Ｂ：戦闘員控え室、Ｃ：倉庫、Ｄ：牢屋 |
| ■備考 ７０９コロニーのイベントでバグと戦うと町マップに出現する。 入ってすぐのマシーン大元帥の部屋でエージェントとのボス戦。 ショッカー最後の基地だけあって無人の部屋はない。 Ｄの牢屋はエージェント撃破前に来てもヒーローたちを解放できない。 |
| 月面・グラナダ基地（第８話） |
| ■出現敵キャラ（１Ｆのみ） バルタン星人３世、ガッツ星人、デナンゾン、デナンゾン（黒）、ベルガダラス、 ベルガダラスＰＷ、ベルガギロス、ベルガギロスＰＷ、ラフレシア、エージェント |
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| ■各部屋 Ａ：パソコン室、Ｂ：控え室、Ｃ：司令室、Ｄ：司令室（２Ｆ） |
| ■備考 １Ｆ司令室に鉄仮面（ラフレシア）。倒すと２Ｆ司令室にエージェントが出現する。 ラフレシアを倒すまでエージェントはいない。 地上扱い（ウルトラ戦士はカラータイマーによるタイムリミットがある） 屋外扱い（ガンダムキャラはＭＳで戦闘できる） |
| 亜空間（第８話） |
| ■出現敵キャラ システム、ウルトラキラー、巨大ヤプール |
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| ■ルート １の位置が初期。２→３、５→３、４→６、７→１３、１２→４、５→１、２ 脱出時：２、１→５、３→１、２ |
| ■備考 間違ったルートを進むと無限ループになる。 地上扱い（ウルトラ戦士はカラータイマーによるタイムリミットがある） 屋外扱い（ガンダムキャラはＭＳで戦闘できる） |